一般情況下，代理出口退稅中的運費承擔問題，需要根據(jù)代理協(xié)議的具體條款來確定。在簽訂代理協(xié)議時，雙方應該明確約定運費的承擔方。如果協(xié)議中沒有明確規(guī)定，那么可以按照國際貿(mào)易的慣例來處理。通常來說，如果是以FOB（離岸價）成交，那么運費由買方承擔；如果是以CIF（到岸價）成交，那么運費由賣方承擔。在代理出口退稅的情況下，如果代理公司只是負責辦理退稅手續(xù)，而貨物的運輸由委托方自行安排，那么運費自然由委托方承擔。如果代理公司同時負責貨物的運輸和退稅手續(xù)，那么雙方可以協(xié)商確定運費的承擔方式。總之，運費的承擔問題應該在代理協(xié)議中明確規(guī)定，以避免后期出現(xiàn)糾紛。

需要注意的是，不同的貿(mào)易方式和合同條款可能會對運費的承擔方產(chǎn)生影響，因此在簽訂合同前，雙方應該仔細協(xié)商并明確相關(guān)條款。

另外，如果在代理出口退稅過程中出現(xiàn)了運費爭議，雙方應該首先通過友好協(xié)商的方式解決。如果協(xié)商不成，可以根據(jù)合同中的爭議解決條款，通過仲裁或訴訟等方式解決爭議。

這得看您和代理公司當初的約定，合同里寫清楚了就按合同來，沒寫的話就得商量著來了。

一般按照貿(mào)易慣例，F(xiàn)OB的話買方負責運費，CIF的話賣方負責，您可以根據(jù)實際情況判斷一下。

要是代理公司負責運輸，那可能他們會承擔一部分或全部運費，具體還得看雙方協(xié)商。

其實運費誰承擔都有可能，關(guān)鍵是要在合作前就把這些問題說清楚，免得后面麻煩。

您可以查看一下代理協(xié)議中關(guān)于費用的條款，看看有沒有提到運費的承擔問題。

如果沒有明確規(guī)定，雙方可以根據(jù)貨物的價值、運輸距離等因素來協(xié)商確定運費的承擔方。

也可以參考同行業(yè)的慣例來解決運費承擔的問題，但最終還是要以雙方協(xié)商的結(jié)果為準。

在確定運費承擔方時，要綜合考慮各種因素，確保雙方的利益都能得到保障。